按照國家有關規定，從事涉及國家秘密的計算機信息系統集成業務的單位，須經保密工作部門審批，并取得《涉及國家秘密的計算機信息系統集成資質證書》，方可從事涉密信息系統集成業務。 為進一步加強對涉及國家秘密的計算機信息系統的規范化管理，確保國家秘密信息的安全，國家保密局修訂下發了新的管理辦法。原頒發的資質證書有效期截止到2005年9月30日，從2005年10月1日起啟用新的資質證書。根據新的管理辦法規定，涉密系統集成資質分為甲級、乙級和單項三種，并引入了評估機制。

涉及國家秘密的計算機信息系統集成資質的種類與限定如下：

涉密系統集成資質分為甲級、乙級和單項三種資質。

A、甲級資質單位可在全國范圍內承接涉密信息系統的規劃、設計和實施業務，并僅可承擔本單位承建的涉密信息系統的系統服務和系統咨詢工作，不得從事其它單項資質業務。

B、乙級資質單位僅限在所批準的省、自治區、直轄市所轄行政區域內承接涉密信息系統的規劃、設計和實施業務，并僅可承擔本單位承建的涉密信息系統的系統服務和系統咨詢工作，不得從事其它單項資質業務。

C、單項資質單位可在全國范圍內開展業務，但僅限承接所批準的涉密系統集成單項業務，如：軟件開發、綜合布線、系統服務、系統咨詢、屏蔽室建設、風險評估、工程監理、數據恢復等。

取得甲級或乙級資質的單位如需承接單項業務，必須申請并取得相應的單項資質。取得某一單項資質的單位如需從事其它單項業務，必須申請相應的單項資質。

單項資質包括：風險評估、工程監理、屏蔽室建設、軟件開發、數據恢復、系統咨詢、系統服務、綜合布線、軍工。自2007年1月1日起增加了“保密安防監控”的單項資質。

獲得甲級資質的企業可承接全國范圍的計算機涉密集成業務，不得承接單項業務；獲得乙級資質的企業可承接省內（申請地所在）的涉密計算機集成業務，不得承接單項業務；獲得單項資質的企業可以承接全國范圍內該企業所取得的單項業務，不得承接綜合集成業務。通俗地講若一個企業既想承接綜合集成業務又想從事單項業務至少需要獲得兩個認證。

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